El río Babahoyo es un importante río de las provincias ecuatorianas de Los Ríos y Guayas, en la vertiente pacífica del país.
En este punto el Babahoyo alcanza un ancho de 1800 metros.
Su confluencia con el Daule da inicio al río Guayas, principal arteria fluvial de la Costa ecuatoriana.
Entre las principales especies presentes en el río están: la tilapia (Oreochromis spp.
), vieja azul (Andinoacara rivulatus), guanchiche (Hoplias microlepis), dica (Pseudocurimata boulengeri y Pseudocurimata troschelii), bagre ciego (Paracetopsis bleekeri), chame (Dormitator latifrons), barbudo (Rhamdia quelen) y bocachico (Ichthyoelephas humeralis).