Las Reacciones en Cadena, se crean cuando los puyos que caen, ya por acción del jugador o por unos puyos que caen de una cadena anterior, causan una reacción en cadena donde los grupos de puyos se borran, uno por vez.

En el modo SUN, el jugador recibe puyos solares si se vacía el tablero.

En el modo Fever, el jugador recibe el nuevo set de cadenas predefinidas y decide si quiere hacerla o aumentarla.

Cuando se ejecuta una cadena, aparecen los puyos basura (que son transparentes) en la parte superior del oponente.

Cuanto más grande sea la reacción en cadena, más puyos basura son enviados al oponente, que cae en su zona de juego y dificulta su jugada.

Su valor es determinado por la puntuación total de la cadena dividida por 70 y redondeada al entero más próximo: Si se borran más puyos sucesivamente debido a una reacción en cadena, la cantidad de puyos ruidosos aumentará hasta que la cadena termine.

Además, si se le acaba el tiempo, la cantidad de puyos ruidosos aumenta drásticamente.

Si la tercera columna (contando desde la izquierda), se llena hasta la parte superior, sea de puyos normales o ruidosos, el jugador o el oponente en cuestión pierde.

En modos como Fever, se requiere que el personaje tenga llena cualquiera de las dos columnas centrales.

La siguiente versión lanzada es Puyo Puyo 2, sobre la cual se dice que ha tenido 15 lanzamientos, uno por consola, incluyendo una versión para PC, arcades con placa System C2 y un remake.

El primer juego se lanzó en febrero de 1993 bajo el nombre de Dr. Robotnik's Mean Bean Machine (para Sega Mega Drive/Sega Genesis y Sega Game Gear).

Las únicas entregas que salieron fuera de Japón para Nintendo Switch y PlayStation 4 son: