El arte también es muy diferente de sus predecesores, adoptando un tono más serio en comparación con los otros juegos.

Puyo Puyo~n Party 64 para Nintendo 64 tiene música diferente a la versión Dreamcast y carece de las voces interpretadas, pero retuvo el modo multijugador para cuatro jugadores e incluyó un modo Transfer Pak donde se puede desbloquear más ilustraciones al conectar Pocket Puyo Puyo SUN.

Son recibidos por una figura misteriosa en Pierrot, un personaje de aspecto bufón.

Cuando Arle llega, algo no parece correcto y Carbuncle desaparece una vez más.

Satan le explica a Arle que un enemigo más fuerte le lavó el cerebro, y Pierrot aparece después, revelándose que ella es Doppelganger Arle.

Los dos se pelean para ver quién existe en el mundo, y Arle salió victoriosa.

Segundos después, Carbuncle reapareció en la habitación y Arle se emocionó al verlo nuevamente.