Paulatinamente, las autoridades españolas transformarían los manglares entre ambas zonas para dar paso a un mayor puerto.
El puerto fue afectado por el bloqueo naval a Venezuela de 1902-1903.
En el siglo XX las instalaciones portuarias de Puerto Cabello eran administradas por el gobierno regional a través del Instituto Autónomo de Puerto Cabello.
[1] En 2009 el presidente Hugo Chávez le quitó la administración de los puertos a la gobernación y la transfirió a un organismo controlado por el ejecutivo nacional, Bolipuertos.
A partir de 2010 el puerto ha sido asociado con escándalos por el caso PDVAL.