Las funciones específicas del Proyecto Especial se desarrollan en el respectivo Manual de Operaciones.

[3]​ Las funciones del Proyecto Especial Bicentenario son las siguiente: El Proyecto Especial Bicentenario busca ejecutar, articular y dar seguimiento a las acciones en conmemoración a los 200 años de vida en Independencia del Perú.

Para ello se optó coordinar con organismos constitucionalmente autónomos, autoridades regionales y locales, las acciones necesarias para el desarrollo de agendas regionales.

Con este fin, durante el año 2019 se conformó una Comisión Bicentenario Regional (CBR) por cada región del país, y están presididas en cada caso por el gobernador regional y cuentan entre sus miembros alcaldes provinciales, representantes sociales, académicos, sectores educación, salud, justicia y cultura, de la sociedad civil, así como de la Policía Nacional, del Ejército del Perú, Poder Judicial, Ministerio Público, universidades.

y de otras instituciones relevantes para la región.