[1]​ Su fundador es el doctor Fernando Tamayo Ogliastri, médico ginecólogo.

Hacia 1967 Profamilia se afilia a la Federación Internacional de Planificación Familiar, organización no gubernamental de ámbito mundial que tiene como objetivos generales la promoción de la salud reproductiva y la salud sexual.

En 1969 se realiza por primera vez en Latinoamérica una emisión radial promoviendo la planificación familiar.

En 1971 la primera vasectomía en Colombia con la puesta en marcha del programa de vasectomía y la distribución de anticonceptivos en áreas rurales, y en 1973 se llevan a cabo las primeras ligaduras de trompas por laparoscopia en el país.

En 1985 Profamilia expande sus servicios y da inicio al Programa de Clínicas para el Hombre y en 1986 comienza a prestar servicios legales con la inauguración del programa de Consultoría Jurídica Familiar, con la función de dar asesoría en materia legal para temas relacionados con la familia.