Se disputó desde febrero hasta julio de 2008, bajo el sistema todos contra todos: los doce clubes compiten en dos vueltas (local y visitante), jugando un total de 22 partidos cada uno.
Los clubes son clasificados por puntos, y los criterios de desempate son, en el siguiente orden: diferencia de goles, goles marcados y resultados directos entre equipos empatados.
Si dos equipos quedan empatados en puntos en la primera posición, deben jugar un partido de desempate en cancha neutral para definir al Campeón.
La Paz FC aseguró su participación por segunda vez en su historia en un torneo continental.
Pts=Puntos; PJ=Partidos jugados; G=Partidos ganados; E=Partidos empatados; P=Partidos perdidos; GF=Goles a favor; GC=Goles en contra Resultados del Grupo B (L): En cada llave, el equipo ubicado en la primera línea es el que ejerce la localía en el partido de ida.
En caso de empate en tiempo reglamentario en este tercer partido, se define por penales.
Todas las parejas de clásicos rivales juegan dos partidos (ida y vuelta).
Los ganadores clasifican a cuartos de final, mientras que los 4 mejores perdedores juegan el Repechaje.