La Prefectura del pretorio de Iliria (en latín: praefectura praetorio per Illyricum: praefectura praetorio por Illyricum , en griego: ἐπαρχότης/ὑπαρχία [τῶν πραιτωρίων] τοῦ Ἰλλυρικοῦ: ἐπαρχότης/ὑπαρχία [τῶν πραιτωρίων] τοῦ Ἰλλυρικοῦ, también denominado sencillamente la Prefectura de Illyricum) era una de las cuatro prefecturas del pretorio en las que fue dividido el Imperio romano tardío.
A diferencia de las otras tres prefecturas clásicas que son mencionadas en la Notitia dignitatum, (la Galia, la Italia-África y la Oriente), la historia administrativa temprana de Iliria como prefectura durante el siglo IV implicó su abolición, re-establecimiento y división varias veces.
Fue establecida como prefectura pretoriana con derecho propio durante las luchas dinásticas entre los hijos de Constantino el Grande que siguieron a su muerte en 337.
Se mantuvo en vigor hasta 361, cuando fue abolido por emperador Juliano, y luego revivió bajo Graciano entre 375-379.
En esta ocasión, parece que la capital de la prefectura se trasladó a Sirmio (437-441), pero el cambio es debatido, ya que el norte de los Balcanes estaba en ese tiempo asolado por las invasiones.