De todas maneras, Porteño AC recién se afilia a la Asociación del Fútbol Argentino en 1958, participando en la última categoría mayoritariamente.
Su sede social siempre estuvo emplazada en la intersección de las calles Intendente Garraham y Sarmiento.
[1] En 1958 se afilia a la AFA, siguiendo los pasos de otro club de su ciudad, Leandro N. Alem, que se había afiliado el año anterior e inmediatamente había conseguido el ascenso.
Sin embargo, en 1967 vuelve la movilidad divisional y esta vez no logra salvarse: Porteño retorna a la Primera D.[1] Aquí el equipo muestra otra cara, quizás aprovechando la experiencia y la calidad del plantel propio de una categoría superior: logra entrar a la ronda final durante tres años seguidos.
Sin embargo, en ninguno de los torneos prospera en las fases definitorias y termina quedando eliminado.