El partido sería fundado finalmente en Žilina en 1913 por el político y sacerdote eslovaco Andrej Hlinka,[13]​ junto a František Skyčák.

[14]​ Hasta la desmembración del Imperio austrohúngaro, Hlinka mantuvo una posición contraria a Hungría y la política de magiarización sobre las poblaciones eslovacas, lo que le valió ser encarcelado por las autoridades durante tres años y ser suspendido por la Iglesia en sus funciones.

El propio Hlinka declaró:[16]​[17]​ Tras la creación de Checoslovaquia, el SĽS volvió a recuperar su actividad política.

[20]​ En 1925 la formación política fue renombrada como "Partido Popular Eslovaco de Hlinka" (Hlinkova slovenská ľudová strana, HSĽS).

Durante este periodo se caracterizó por sus políticas claramente conservadoras, su total filiación católica y su postura anticomunista.

El gesto fue un desastre para el partido, que perdió 168.000 votos, aunque continuó siendo la principal fuerza política eslovaca.

Por esas mismas fechas algunos militantes del ala más extremista crearon un grupo paramilitar, la llamada "Guardia de Hlinka", que recuperaba la estela de la desparecida "Rodobrana" y que se acabaría convirtiendo en la milicia privada del SĽS.

Al comienzo de la Segunda Guerra Mundial, Tiso centró sus esfuerzos en reorganizar el partido: reconstruyó los cuadros políticos, nombrando nuevos miembros en el Consejo de dirección, y movilizó a las mujeres para incorporarlas a las bases del HSĽS.

Por el contrario, el ala liderada por Vojtech Tuka estaba muy influenciada por la Alemania nazi, era profundamente antisemita, anti-checa y aspiraba a la creación de un "Estado nacionalsocialista eslovaco".

Después del Insurrección nacional eslovaca durante el otoño de 1944, el país fue ocupado por el Ejército alemán y su autonomía se vio drásticamente reducida.