Allí fundó junto con Abbe, Carl Zeiss y Roderich Zeiss -hijo del anterior- en 1884 un Laboratorio Técnico del Vidrio, después Fábrica de Vidrio de Jena, Schott y Asociados.Este tipo de vidrio se distingue por su resistencia a las altas temperaturas, por su elevada tolerancia al choque térmico y por su resistencia a la degradación química: también se le ha llamado vidrio de Jena.Como consecuencia del crecimiento, sólo en el mencionado año la empresa empezó a ser rentable.Por sus extraordinarias contribuciones fue nombrado en 1905 doctor honoris causa por la Escuela Técnica Superior de Dresde.Su tumba se encuentra en el cementerio del norte de Jena (Feld 14).
