[1]​ En 1996 fue galardonado con el Premio Nacional de Lituania, la mayor distinction artística y cultural en este país.

Sus producciones consisten en sinfonías, conciertos y música de cámara.

Balakauskas en sus primeros años de conservatorio estaba influenciado por Stockhausen, Boulez, Xenakis y en particular por Webern en Messiaen.

Como sea, en los 60, desarrolló su propio sistema armónico, lo que le llevó a un fuerte sentido de la tonalidad, denominado la 'Tonalidad Balakauskas'.

Sus más importantes obras son Sonata of the Mountains inspirado en los cuadros de Mikalojus Konstantinas Čiurlionis (1975), Sinfonía n.º 2 (1979), Opera Strumentale (1987) y Sinfonía n.º 4 (1998) y n.º 5 (2001), las últimas dos obras mencionadas han sido recientemente grabadas por Naxos Records.