Oficina de inteligencia paquistaní

[5]​ Establecida en 1947 como "Establecimiento de Policía Especial (SPE)", la Agencia Federal de Investigación (más conocida popularmente como FIA) fue posteriormente reformada con su nombre y estructura actuales en 1974 por el Gobierno.

La FIA es el principal servicio de inteligencia e investigación, se encarga de tomar iniciativas contra los elementos extranjeros o nacionales que trabajan en contra del interés nacional del país.

[6]​ En 2013, la Corte Suprema ordenó al gobierno enviar estos fondos secretos a cuentas públicas utilizadas en el pasado para derrocar gobiernos políticos.

[11]​ Los líderes baluchis llegaron con éxito a que la Corte Suprema interviniera en el conflicto.

La Corte Suprema emprendió una amplia investigación sobre las "personas desaparecidas" y emitió una orden de arresto contra el expresidente Pervez Musharaff.

Además, el presidente del Tribunal Supremo de la corte dijo que los militares deben actuar bajo la dirección del gobierno y seguir parámetros bien definidos establecidos por la Constitución.