[1]​ Este género fue descrito originalmente en el año 1905 por el ictiólogo inglés Charles Tate Regan.

[2]​ La etimología de Nannacara se construye con la palabra en latín nannus que significa ‘pequeño’ y la palabra en griego kara que se traduce como ‘rostro’.

En el acuarismo es tratado en el grupo de los cíclidos enanos, junto con Apistogramma, Mikrogeophagus y Dicrossus.

La especie del género más comúnmente encontrada en el comercio de acuarismo es Nannacara anomala.

La especie Nannacara hoehnei Miranda Ribeiro, 1918[10]​ fue transferido al género Aequidens.