Menéndez comenzó su carrera en Chacarita Juniors, aunque no llegó a debutar en sus primeros años.
En la temporada 2013-14, el defensor tuvo una participación destacada, ya que disputó 29 encuentros de los 38 del campeonato.
[2] Nahuel debutó con la camiseta del Funebrero el 2 de abril en la victoria por 1-0 contra Atlas, en la fase preliminar metropolitana de la Copa Argentina y Nahuel Menéndez fue titular.
[4][5] Menéndez jugó 34 de los 44 encuentros en la segunda categoría del fútbol argentino.
Sin embargo, el futbolista nacido en Munro apenas disputó un solo encuentro durante su estadía en San Miguel de Tucumán, frente a Belgrano.