[6]​[7]​ Regresó a los Estados Unidos para sus estudios universitarios, asistiendo en el Bryn Mawr College para obtener su título de Bachiller en Ciencias Políticas,[6]​ y luego recibió su doctorado en la Universidad de Duke.

[6]​ Abu El Haj enseñó en la Universidad de Chicago desde 1997 hasta 2002,[6]​ cuando se incorporó al cuerpo docente del Barnard College.

[6]​ En 2001, Abu El Haj publicó Facts on the Ground: Archaeological Practice and Territorial Self-Fashioning in Israeli Society.

[10]​ La forma en que se cruzan la raza, la diáspora y el parentesco, y la forma en que los orígenes genéticos surgen como una preocupación compartida entre quienes buscan reparación o reconocimiento, son temas predominantes en la obra.

[10]​ Revisando el libro de El Haj del 2012, The Genealogical Science: The Search for Jewish Origins and the Politics of Epistemology, el genetista Richard Lewontin, al escribir en The New York Review of Books, la describió como una «determinista genética» no en el «sentido usual», sino porque escribe que «los aspectos fundamentales de quiénes somos están determinados por nuestro pasado» y que «quiénes somos realmente colectiva e individualmente está dado por y es legible en los datos biológicos».

Dietler también dijo que Abu El Haj se oponía porque es de ascendencia palestina.

[1]​ En una crítica de Facts on the Ground publicada en el Columbia Daily Spectator, Segal escribió que se oponía a Abu El Haj por razones profesionales, y no políticas.

[20]​ Segal dijo más tarde en The Forward que Abu El Haj odia a los israelíes.

[22]​ Segal y Dever hablaron en conferencias patrocinadas por Scholars for Peace in the Middle East y LionPAC —un grupo de defensa proisraelí en Columbia—,[6]​ con el objetivo de rebatir a El Haj.

En respuesta a la controversia que rodea el trabajo de Abu El Haj, la presidenta de Barnard, Judith Shapiro, dijo que mostrar cómo la investigación arqueológica puede ser utilizada con fines políticos e ideológicos es una empresa antropológica cultural legítima.