En 1643 fue enviado a Nueva Francia junto con los sacerdotes Leonard Garreau y Gabriel Druillettes.
Aunque había estudiado la lengua algoquina durante un tiempo, no la conocía mucho.
Como sintió una fuerte repugnancia por la vida y los hábitos de los hurones, y temió que pudiera resultar en que se retirara del trabajo, se comprometió a sí mismo a no abandonar nunca la misión, excepto bajo obediencia.
Un mes después, Brébeuf y Lalemant fueron capturados en un ataque iroqués en la Misión de St.
Louis y llevados a la cercana Misión de St.