En 1649, Brébeuf y otros misioneros fueron capturados cuando los iroqueses arrasaron un pueblo de los hurones, referido en francés como St.

La Iglesia Católica beatificó a Brébeuf en 1925 y fue canonizado, junto con otros ocho jesuitas, en 1930.

[4]​ Sus notas como estudiante no fueron particularmente buenas, pero Brébeuf tenía facilidad para aprender idiomas.

Posteriormente, en Nueva Francia, enseñaría los idiomas indígenas a los misioneros y comerciantes franceses.

Durante unos cinco meses, vivió con una tribu de los innu, que hablaban algoquino.

Posteriormente, se le envió con los hurones, con el sacerdote Anne Nouée.

Desde entonces, Brébeuf trabajó sobre todo como misionero de los hurones, que hablaban iroqués.

Brébeuf residió durante una breve temporada con la tribu bear en Toanché, pero no logró convertirlos al catolicismo.

Fue convocado a Quebec debido al peligro de que toda la colonia fuese descubierta por los ingleses.

Junto con Antoine Daniel y Ambroise Davost, Brébeuf escogió Ihonatiria (Saint-Joseph I) como el lugar central de su actividad misionera con los hurones.

Su tasa de mortalidad fue alta, ya que no era inmunes a esa enfermedad ampliamente endémica en Europa.

[8]​ Compañeros jesuitas como Ragueneau describieron su facilidad y adaptabilidad al estilo de vida hurón.

Fue enviado a Quebec para recuperarse, y trabajó como procurador de la misión.

[4]​ El rigor educativo de los seminarios jesuitas preparaba a los misioneros para adquirir las lenguas nativas.

[8]​ Pero, como ellos habían aprendido las lenguas clásicas y romances, ellos tenían mucha dificultad con las diferentes normas lingüísticas de los idiomas indígenas del Nuevo Mundo.

Él mostraba a la gente que no acabaría con todas sus creencias tradicionales.

[13]​ Brébeuf trabajó incansablemente para registrar sus hallazgos en beneficio de otros misioneros.

Se basó en el trabajo de los franciscanos recoletos y avanzó significativamente en sus estudios, sobre todo en las representaciones fonéticas.

Descubrió y escribió sobre las características de las palabras compuestas en hurón, lo que pudo haber sido su mayor contribución lingüística.

Hacia 1642, Brébeuf compuso el villancico hurón, que es la canción navideña más antigua de Canadá.

La música está basada en la canción tradicional francesa Une Jeune Pucelle (Una bella criada).

[18]​ Brébeuf fue capturado junto con Gabriel Lalemant cuando los iroqueses destruyeron la Misión de Saint-Louis, en territorio hurón.

[23]​ Regnault fue a ver los cuerpos para verificar los relatos y el escrito de su superior Rageuneau se basó en su informe.

Los relatos jesuitas de su tortura enfatizan su naturaleza estoica y aceptación, alegando que sufrió en silencio sin quejarse.

John Brebeuf de Abbotsford, Columbia Británica,[42]​ y el Instituto Católico St.