Su programación es suministrada por las distintas organizaciones sociales de las que está compuesto el ente radiodifusor.
Inicialmente fue un proyecto conjunto entre NPO y el radiodifusor flamenco VRT, que en aquella época se llamaba BRTN.
Posteriormente Nederland 3 pasó a depender de las organizaciones VPRO, VARA, BNN y NOS, de esta forma la programación del canal se enfocó en noticias, debate, cultura y programación infantil bajo la marca Z@ppelin.
A partir de las 19:30 comienza la programación para jóvenes y adultos incluyendo series, películas, dramas y programas de comedia, tanto nacionales como extranjeros.
Algunos de sus programas más exitosos que ha emitido son Top of the Pops, College Tour o Spuiten en Slikken.