[6]​ La especie M. roraimae fue descrita por primera vez por los zoólogos británicos Osbert Salvin y Frederick DuCane Godman en 1883 bajo el nombre científico Myiobius roraimae; su localidad tipo es: «Monte Roraima, Guyana».

[5]​ El nombre genérico masculino «Myiophobus» se compone de las palabras del griego «μυια muia, μυιας muias» que significa ‘mosca’, y «φοβος phobos» que significa ‘terror’, ‘miedo’, ‘pánico’; y el nombre de la especie «roraimae», se refiere a la localidad de su descubrimiento, el Monte Roraima.

(2008)[8]​ presentaron datos genético-moleculares demostrando que el género Myiophobus era altamente polifilético, formado por tres grupos que no son ni cercanamente parientes entre sí; la presente especie, junto a Myiophobus phoenicomitra, M. inornatus y M. flavicans forman uno de dichos clados.

(2020) propusieron un nuevo género Scotomyias para reflejar adecuadamente la filogenia del género,[3]​ pero esto no ha sido adoptado por la mayoría de las clasificaciones, excepto por el Comité Brasileño de Registros Ornitológicos (CBRO).

[9]​ Según las clasificaciones del Congreso Ornitológico Internacional (IOC)[10]​ y Clements Checklist/eBird[11]​ se reconocen tres subespecies, con su correspondiente distribución geográfica:[6]​