Cuando, por azares del destino, Tutmosis IV llegó a rey, Mutemuia se tuvo que contentar con ser desplazada por dos princesas de sangre real (Nefertari e Iaret), que ocuparon el cargo de Gran Esposa Real, cosa que ella solo conseguiría a la muerte de su marido.

Cuando Amenhotep III fue coronado faraón tras el breve reinado de Tutmosis IV, Mutemuia asumió la regencia del niño, de apenas doce años, y concertó con su posible hermano Yuya el matrimonio con Tiy, desechando las candidaturas de las hijas nacidas del difunto Tutmosis IV con sus dos grandes esposas reales (es probable que Mutemuia les guardase inquina por haberla desplazado).

Es innegable el poder que ejerció esta mujer sobre su hijo, sobre todo en los primeros años de reinado.

Aparte de Amenofis III, Mutemuia tuvo otros hijos con Tutmosis IV, como el joven Amenemhat.

En total llevó los siguientes:,[1]​ Los dos últimos son equivalentes, ya que el Faraón se había declarado dios.