Su sede es un edificio construido con el propósito de ser un museo de historia natural con vitrales y decoraciones en yeso que muestran temas zoológicos.
Su exposición permanente alberga una serie de animales disecados, fósiles, réplicas de fósiles y diversa información educativa.
Otras instalaciones del museo incluyen una biblioteca especializada en zoología y laboratorios dedicados a la investigación en cronobiología, microscopía electrónica, biología molecular, histología y tomografía computarizada.
El Museo fue cerrado en 2011 para reformas y fue reabierto en 2015 con novedades como la exposición «Biodiversidad: conocer para preservar».
La organización interna del Museo de Zoología cuenta ahora con una nueva escenografía y animales más diversos en su galería además de un nuevo laboratorio abierto al público para que las personas puedan interactuar con una simulación del museo entre bastidores.