Está ubicado en la Carretera Federal Xochicalco-Tetlama sin número, en la Col.

En la primera sala se describen los aspectos físicos y naturales del territorio en sus periodos de ocupación, junto con sus relaciones comerciales con otros pueblos.

En la segunda se describe la organización de los estratos sociales xochicalcas.

El museo se emplaza en un predio de 12.676 m² sin servicios urbanos de drenaje, agua potable ni electricidad, por lo que el inmueble fue concebido como autosuficiente en sus servicios y climatización, considerándolo como el primer museo ecológico del mundo.

[1]​ Conduce y usa luz natural, cuenta con celdas fotovoltaicas para generar su propia energía eléctrica.