Acabada la Guerra Civil Española los mosaicos y otros objetos son guardados a unas dependencias parroquiales hasta el año 1951, al inaugurarse el Museo Arqueológico Municipal de Manacor.

Este edificio está vinculado a Pelai Uniç, a quien el conde Nuño Sánchez le cedió ciertas propiedades en el término de Manacor en el siglo XIII, justo después de la conquista.

En los siglos XV-XVI se añadió otro cuerpo que presenta una ventana conopial en el piso superior El museo no se limita a las piezas cerámicas procedentes de las excavaciones de yacimientos prehistóricos, sino que entra a campos considerados menores o de menos entidad.

Entre las salas habilitadas de manera permanente hay que señalar la de Prehistoria, constituida en buena medida con las piezas procedentes del yacimiento del Hospitalet; el espacio dedicado a la época romana; el de la antigüedad tardía, en el cual destacan los mosaicos y las piezas procedentes de la basílica de Son Peretó; la época medieval islámica y la sala dedicada a los muebles en miniatura.

La sección etnográfica está ubicada al Molino de en Fraret.