Expone importantes colecciones geológicas, botánicas y zoológicas de múltiples procedencias.

[3]​[4]​ El MCNA cuenta con tres grandes secciones repartidas en sus dos plantas: una dedicada a la Geología (Petrología, Mineralogía, Paleontología de vertebrados, Paleontología de invertebrados y Geología general), otra a la Botánica (Botánica criptógama y Botánica fanerogámica) y por último la dedicada a la Zoología (Zoología de invertebrados y Zoología de vertebrados).

En conjunto, las colecciones superan en total el medio millón de registros.

[7]​ La actividad científica del Museo ha dado como resultado asimismo el descubrimiento de importantes yacimientos paleontológicos y nuevos conocimientos relativos a los sistemas biológicos y medio físico en el que se desarrollan.

[18]​ Para consultar horarios y actividades se puede acceder a la página web del Museo.