La institución fue fundada en 1962 como Instituto Panameño de Arte, en 1983 se convirtió en el museo actual.

En 1983, la junta directiva de Panarte decidió buscarle paredes a la Colección, para que siguiera creciendo en tamaño y en excelencia.

Se comenzó una gran campaña, donde contribuyeron muchas personas y empresas.

De esta forma, se logró darle paredes a la Colección Permanente y se creó el Museo de Arte Contemporáneo, perteneciente a Panarte.

Abarca todas las técnicas: pintura, escultura, gráfica, fotografía y, más recientemente, instalaciones.