[3]​ Se encuentra ubicado en la calle Roque González 550, en el Parque Paraguayo de la capital misionera.

La municipalidad de Posadas había entregado en comodato a la junta el terreno en el Parque Paraguayo.

El museo posee colecciones de las culturas altoparanaense, umbú, eldoradense, tupí-guaraní, guayakí, jesuítico-guaraní y sobre la Edad Contemporánea en la provincia.

[6]​ También cuenta con una colección de la simbiosis mataco-guayakí, una biblioteca y una hemeroteca.

[5]​ Al momento de su apertura, el edificio original tenía una gran sala central y dos a los costados.