[6]​ Además de exhibir su colección, el museo organiza actividades educativas, como visitas guiadas, talleres y charlas.

Originalmente, el espacio que ahora alberga el museo fue parte de un antiguo colegio y casa parroquial utilizado por los jesuitas.

[1]​[7]​[2]​ El padre Antonio González Dorado lideró la restauración del antiguo espacio que hoy alberga el Museo Diocesano de San Ignacio Guazú.

Se encuentra ubicado en la calle Padre Marcial Lorenzana y Cerro Corá.

[9]​ Alberga diversas colecciones, principalmente de arte sacro, que incluyen pinturas, esculturas, objetos litúrgicos y documentos históricos.