Sin embargo, en 1963 este edificio quedó dañado por cuestiones geológicas y los objetos del museo tuvieron que trasladarse inicialmente a ubicaciones provisionales hasta que en 1965 se instalaron en un edificio residencial construido en 1912 y comprado por el Ministerio del Interior de Grecia.

Este edificio pasó a depender del Ministerio de Cultura en 1990.

Por tanto, el museo está compuesto desde entonces por los dos edificios, que están separados por pocos metros de distancia.

En el patio se encuentran elementos arquitectónicos de los periodos helenístico y romano así como algunas esculturas de gran tamaño.

[2]​ El edificio nuevo, a diferencia del antiguo, fue concebido para tener específicamente una función de museo.