El municipio de Rafael Delgado tiene un clima templado-húmedo a una temperatura de 18 °C, con pocas lluvias en invierno, más abundante en verano y al inicio del otoño.
El municipio de Rafael Delgado es más conocido como San Juan del Río (no es el nombre oficial): la mayoría de autobuses de esa localidad en su mayoría tienen rotulado como destino San Juan del Río, y no Rafael Delgado.
Otro grupo importante con rápido crecimiento en el municipio son los Testigos de Jehová muy activos en su labor evangelizadora.
Tampoco cuenta con un hospital, sólo con 2 clínicas distribuidas en la cabecera municipal y Jalapilla.
El municipio tiene problemas graves como vandalismo y un gran número de varones adultos son alcohólicos, con la desnutrición siendo otro de los problemas a los que debe hacer frente.