Se ubica en el sureste del estado, enclavado en el municipio de Linares.
Junto con Chahuites, Oaxaca, es uno de los dos municipios de México que se encuentran enclavado sobre otro municipio.
Su nombre se debe a los primeros habitantes de la zona los indios gualagüises.
[5] El municipio tiene una superficie de 127.80 km² El municipio es regado por el Río Hualahuises que comienza en Iturbide en la Sierra Madre Oriental, pasa por Hualahuises, recibe aguas del Río Camacho y del arroyo de Laja que desemboca en el Río Pablillo que se encuentra en el municipio de Linares.
El relieve de la región es generalmente plano, constituye una Llanura; las elevaciones del municipio no son de gran altitud.