[16]​[17]​ El nombre de Atotonilco deriva de las raíces náhuatl atl, -agua- totonqui -caliente- y co en o dentro; que unido le da el significado a Lugar en donde el agua hierve.

[4]​ En cuanto a su geología corresponde al periodo neógeno (65.0%), cretácico (14.0%) y cuaternario (5.23%).

[4]​ En cuanto a edafología el suelo dominante es phaeozem (53.0%), leptosol (31.0%) y vertisol] (0.23%).

[13]​[14]​ La flora se encuentra conformado por cerros de pastos naturales, matorrales, pastizales matorrales y bosques de especies maderables y no maderables.

[13]​[14]​ En cuanto a fauna las especies que predominan en este territorio son el conejo, liebre, ardilla y una fuerte cantidad de reptiles como el camaleón, lagartija, víbora aunado a una variedad de arácnidos e insectos.

[21]​ El porcentaje de población según situación conyugal,[nota 6]​ el 32.9 % se encuentra casada, el 30.6 % soltera, el 26.1 % en unión libre, el 5.7 % separada, el 1.4 % divorciada, el 3.3 % viuda.

[21]​ Predominan las viviendas con los siguientes materiales: tabique, ladrillo, block, piedra, cantera, cemento o concreto.

[14]​ En ganadería según su importancia: ganado bovino, ovino, porcino y aves.

[14]​ Para 2015 cuenta con 12 tiendas Diconsa, y 5 tianguis semanales en el cual se expenden productos de la región.