El municipio de Apaseo el Alto se encuentra localizado en el sureste del territorio guanajuatense.
Todos los pequeños ríos y arroyos pertenecen a la vertiente del Océano Pacífico.
Predomina la topografía semiplana, aunque el municipio está enclavado en la Sierra de los Agustinos.
La vegetación se constituye básicamente de mezquites, huizaches, nopales y órganos; los pinos y encinos caracterizan los montes más elevados, mientras que los sabinos o ahuehuetes abundan en las riberas de los ríos como el Lerma, Apaseo o el Arroyo del Sabino.
Las especies forrajeras existentes son pata de gallo, zacatón amor, flechilla, tempranero, tres barbas, navajita filiforme y glandular, banderitas, colorado, búfalo, falsa grama, popotillo, cola de zorra, lanudo y lobero.