Del inmueble también destaca su iglesia, coro, claustro, sala capitular y refectorio, entre otros.Durante esos tres años desaparecieron innumerables obras de arte del monasterio.Las paredes de la iglesia están enfoscadas y se encuentran adornadas con varias pinturas al fresco del siglo XVII.En los laterales del retablo están colocadas las imágenes de santo Tomás de Aquino y san Pedro de Verona, y sobre ellos están colocados tres relieves que representan la Anunciación, la Venida del Espíritu Santo y la Visitación.En los laterales de la iglesia están colocados dos pequeños altares, ambos altares de principios del siglo XVIII, que se asemejan en estilo al retablo mayor del templo.En la iglesia existen dos coros, uno lateral y otro colocado a los pies de la nave del templo.En el coro están colocados varios retablos barrocos y un órgano.En el refectorio está expuesta una colección de sargas del siglo XVI, con influencias flamencas y florentinas.
