MOBI fue originalmente una extensión del formato PalmDOC al que se añadieron ciertas etiquetas HTML de datos, usando el algoritmo de compresión LZ77.

El formato ha ido variando sus especificaciones a lo largo del tiempo, añadiendo nuevas etiquetas.

Por tanto es probable que un lector antiguo no sea capaz de manejar correctamente un nuevo documento.

En abril de 2005 Mobipocket SA fue comprada por Amazon, que se hizo propietaria del formato.

Dado que ambos formatos sin DRM son idénticos, el lector de libros electrónicos Amazon Kindle puede leer perfectamente archivos MOBI.