Los equipos de los Golden Gophers participan en las competiciones universitarias organizadas por la NCAA, y forman parte de la Big Ten Conference.

El equipo de baloncesto masculino se ha hecho en dos ocasiones con el campeonato nacional, en 1902 y en 1919.

De esta universidad proceden baloncestistas notables como Kevin McHale, Bobby Jackson, Voshon Lenard y Mychal Thompson.

El equipo más exitoso de la universidad es el de fútbol americano.

Los Golden Gophers poseen en sus vitrinas seis campeonatos nacionales, 18 campeonatos de conferencia y 11 bowls.