Surgió como ministerio nuevamente varias veces bajo denominaciones diferentes.
En diciembre de 2023 fue disuelto mediante DNU tras la asunción del presidente Javier Milei haciendo modificación en el Decreto 438/92, en el cual se reduce de 18 a 9 ministerios.
En 1991 sus secretarías fueron incorporadas al nuevo Ministerio de Economía, Obras y Servicios Públicos.
En 2003 el presidente Néstor Kirchner crea el Ministerio de Planificación Federal, Inversión Pública y Servicios, que reagrupó secretarías pertenecientes a los antiguos ministerios de Obras Públicas, Comunicaciones, Trabajo y Previsión e Industria y Comercio.
Al frente del Ministerio de Interior, Obras Públicas y Vivienda designó como Ministro a Rogelio Frigerio, a Oscar Aguad como Ministro de Comunicaciones y a Juan José Aranguren al frente del Ministerio de Energía y Minería, que fue el que absorbió la mayor cantidad de Secretarías del disuelto Ministerio de Planificación.
Tiene su entrada principal por Hipólito Yrigoyen 250, y 15 pisos de altura.