[4]​ Las funciones del Ministerio son:[5]​ El Ministerio como rector del sector y del SNCTI formula y articula la política pública para la generación de conocimiento, la innovación, la apropiación social y la competitividad.

Potencia las capacidades regionales y sectoriales de investigación e innovación para la consolidación de la sociedad del conocimiento.

Igualmente, promueve el bienestar social, el desarrollo económico, productivo, sostenible y cultural del territorio y de sus pobladores.

Igualmente, será identificado por su liderazgo e impacto en las regiones y por promover su Desarrollo Sostenible desde la investigación y la innovación, a través de la articulación Universidad, Empresa, Estado y Sociedad.

[6]​ El Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación está conformado por el Despacho del Ministro, las oficinas asesoras y de apoyo, dos viceministerios y la secretaría general, de esta forma:[7]​ La siguiente es la lista de titulares que ha tenido la cartera desde su creación en 2020: