Durante su etapa de estudiante se interesó en la música influido por artistas como Atahualpa Yupanqui y Violeta Parra.

Durante la década de 1960 fundó junto con otros artistas vascos el grupo cultural Ez Dok Amairu (No Hay Trece, haciendo uso de dicho número como referencia a la mala suerte), que buscaba revitalizar desde diversos ámbitos la cultura vasca, muy reprimida durante la dictadura franquista.

Su obra combina viejas canciones populares reinterpretadas con un estilo más moderno, poesías musicadas de autores como Bertolt Brecht y composiciones propias.

Algunas de sus canciones se han convertido ya en clásicos populares que forman parte del folclore vasco, especialmente el Txoria txori ('El pájaro (es) pájaro', en castellano), quizá su canción más conocida, que ha llegado a ser interpretada por Joan Báez y el eurovisivo Salvador Sobral con su letra original en euskera.

Otras canciones destacadas son Gure hitzak (Nuestras palabras), Haika mutil y Baga, biga, higa (en colaboración con el Orfeón Donostiarra).

Sus Lekeitios comprenden los discos 7 a 11, aunque sólo se publicó un recopilatorio de los mismos por su escasa comercialidad.

Les siguió el 12 y Laboa se saltó el número 13 como homenaje al grupo Ez Dok Amairu, ya que este nombre significa «No hay trece» en euskera.

[5]​ En 2012 la UPV-EHU creó la cátedra Mikel Laboa con el objetivo de promover la investigación científica y la crítica sobre el arte vasco.