[3] La mezquita es conocida por albergar una de las primeras y más grandes universidades en la historia del Islam.[4] Entre los académicos que se graduaron de Zitouna durante mil años, se encuentran Ibn 'Arafa, uno de los mayores académicos del Islam, Imam Maziri, el gran tradicionalista y jurista, y el famoso poeta tunecino Aboul-Qacem Echebbi.[5] Por su parte, Ahmed In Abu Diyaf e Ibn Abi Dinar atribuyeron la orden a Hassan Ibnu-Noauman quien lideró la conquista musulmana del Magreb.[7] Una inscripción en la base de la cúpula del mihrab indica que los trabajos fueron ejecutados por el arquitecto Fathallah.A comienzos del siglo XIII, Túnez se convirtió en capital de Ifriqiya bajo la dinastía háfsida.
