[3] Dos años después de Metro 2033, Artyom dejó la Orden Espartana y ahora vive en su estación natal, VDNKh, con su esposa Anya.
Artyom, que afirma haber escuchado un mensaje de radio en la Torre Ostankino, intenta establecer contacto con otros supervivientes en el mundo transmitiendo mensajes de radio subiendo a la superficie altamente irradiada, pero nunca recibe ninguna respuesta.
Anya considera infructuosos los esfuerzos de Artyom y su negativa a tener hijos con ella hace que su relación se deteriore.
Miller encarga a Letyaga y Artyom que entreguen un mensaje al Führer del Reich.
Artyom le cuenta a Homero sus visiones de un Moscú alternativo.
Sasha y Artyom tienen una breve aventura; ella le dice que probablemente solo le queden tres semanas de vida debido a su exposición a la radiación.
Acompañado por Lyokha y un explorador de superficie llamado Savelii, Artyom descubre el puesto avanzado de Balashikha y mata a los hombres que se encuentran dentro.
Se despierta en Tagansky Protected Command Point, un antiguo búnker del gobierno, y ha recibido tratamiento para su radiación.
Bessolov revela que él y los otros miembros del búnker controlan en secreto las principales facciones del Metro detrás de escena y mantienen a la gente en el Metro para preservar la civilización.
Miller organiza un tribunal de camaradas para juzgar a Artyom, Lyokha y Letyaga, con Homero como testigo.
Lyokha llega con Bessolov pero le revela a Artyom que ha aceptado una oferta de este para unirse al grupo del búnker, Bessolov le daría trabajo.
En el epílogo, Lyokha ve a Artyom y Anya salir de Moscú, pero Bessolov le dice que los deje ir.
El escritor afirmó que mientras escribía la trama y los diálogos del juego, la historia superó el marco de un videojuego, por lo que decidió escribir un libro al respecto.
Sin embargo, el libro no se publicó en 2014 y la fecha de lanzamiento final solo estaba por ser revelado al año siguiente.
A finales del mismo mes, Európa Könyvkiadó imprimió una traducción al húngaro de József Goretity.