El Me 209 A1 fue desarrollado en 1937 por Willy Messerschmitt, en principio como un monoplano monomotor concebido para establecer un nuevo récord mundial absoluto de velocidad.
El Me 209 V1 fue diseñado con la cabina desplazada hacia atrás debido a que el sistema de refrigeración por líquido ocupaba una gran sección acoplada al motor y que involucraba la unión de las alas, fue dotado con tren retráctil y una configuración pensada exclusivamente en alcanzar altas velocidades como efectivamente lo fue.
De todos modos, la marca de velocidad establecida por Wendel no fue superada hasta 30 años después, en 1969 por un Grumman F8F Bearcat altamente modificado pilotado por el piloto estadounidense Darryl G.
Se realizaron entonces dos prototipos Me 209A (V5 y V6) armados con ametralladoras MG 131 y 151 de 13 y 20 mm respectivamente, se aumentó la envergadura alar a 10,95 m y se mejoró la configuración de cola en cruz para darle más estabilidad al momento de aterrizar; se alargó el fuselaje a 9,7 m pero con estas modificaciones resultó más lento al alcanzar sólo 725 km/h, descartándose de forma definitiva.
Los prototipos fueron almacenados y al menos parte de uno sobrevivió al conflicto y se conserva en el Museo Polaco de Aviación en Cracovia, Polonia.