El tema de investigación del MPI-CBG radica en las cuestiones científicas fundamentales relativas a la organización de la biología a diversas escalas: ¿Cómo se organizan las biomoléculas en una célula en funcionamiento?
El MPI-CBG está dirigido por seis directores titulares o jefes de grupo:[3] Anne Grapin-Botton (Francia) como directora general, Anthony Hyman (Reino Unido), Marino Zerial (Italia), Stephan Grill (Alemania), Heather Harrington (EE.
[4] Junto con los grupos de directores,[5] 23 grupos de investigación independientes dirigidos por investigadores principales no titulares y unas 21 instalaciones[6] componen la plantilla del instituto.
En total, el instituto emplea a unas 550 personas, de las cuales aproximadamente la mitad no son alemanas.
Además, gestiona un programa internacional de doctorado junto con los vecinos antes mencionados.