Con Los Vengadores derrotados y ganándose el repudio del público, la empresa A.I.M.

parecen nobles, en el fondo se forma una conspiración para acabar de una vez con todos los héroes.

Solo una joven súper humana, Kamala Khan, puede reunir de nuevo a los héroes más poderosos del planeta y detener los planes malignos de A.I.M.

[17]​ Cada héroe se puede personalizar con mejoras de rendimiento y nuevas habilidades, también cuentan con diferentes trajes.

[21]​ Bill Rosemann, director creativo de Marvel Games, anunció que The Avengers Project será un juego que dure muchos años, haciendo énfasis en la historia completamente nueva con la que contará el juego y la variedad de personajes y escenarios.