Miembro del PRI desde 1974, llegó a ocupar los cargos de secretaria general del comité estatal de Chiapas y presidenta del Congreso de Mujeres por el Cambio.
En 1991 fue postulada candidata del PRI y elegida diputada federal por el Distrito 6 de Chiapas a la LV Legislatura que ejerció de dicho año a 1994.
Posteriormente ocupó cargos como coordinadora general del Comité de Planeación para el Desarrollo (COPLADE), y oficial mayor y subsecretaria de Desarrollo Rural de Chiapas.
En 1997 fue elegida por segunda ocasión diputada federal, en esta ocasión por el principio de representación proporcional, a la LVII Legislatura que concluyó en 2000.
Aguilar Bodegas solicitó y recibió licencia al cargo el 19 de mayo de 2006 para ser candidato del PRI a gobernador de Chiapas en las elecciones de ese año y el mismo día Marlene Herrera Díaz asumió la titularidad de la senaduría hasta el fin del periodo constitucional, el 31 de agosto del mismo año.