Jugaba como mediocampista y se retiró en Charlotte Eagles de Estados Unidos.

En el expreso rojo, jugaría hasta 2007, siendo una alternativa en el onceno cardenal.

Para el 2008, Mario Efraín, se iría a préstamo por un año al Atlético Juventud, que tenía un convenio con Independiente Santa Fe para que el equipo bogotano prestara sus jugadores para que estos tuvieran minutos, y así coger experiencia.

Durante ese año, tendría actuaciones destacadas, y en el segundo semestre del año, ganó la Copa Colombia 2009, dándole una alegría a la hinchada santafereña.

En Independiente Santa Fe, seguiría teniendo buenas actuaciones y para acabar su segunda etapa en el rojo bogotano, ganó el El apertura 2012, terminando así con 36 años y medio sin títulos de liga para Independiente Santa Fe.