Estudió órgano con Ralph Downes en el Royal College of Music, obteniendo el premio Limpus y becas de investigación en el Royal College of Organists.
Posteriormente estudió en París con Marie-Claire Alain.
Ha participado como miembro jurado en competiciones internacionales y ha impartido clases en cursos de verano internacionales como el que se celebra en Harlem.
Margaret Phillips es miembro del Consejo de la RCO y a menudo preside su junta de exámenes.
Es reclamada como profesora particular y se unió a la plantilla de profesores del RCM en septiembre de 1996.