Al igual que muchos otros pequeños mares de Indonesia, el mar Ceram es rocoso y tectónicamente muy activo.

Las islas de Buru y Seram, antes conocidas como Molucas del Sur, son el hábitat de varias plantas nativas muy codiciadas desde siempre para su uso como especias, como la nuez moscada, clavo y pimienta negra.

Por ello, los mares en torno a ellas eran surcados por varias rutas marítimas de fácil navegación.

Antiguamente, el mar de Ceram era conocido como paso Pitt.

La máxima autoridad internacional en materia de delimitación de mares, la Organización Hidrográfica Internacional («International Hydrographic Organization, IHO), considera el mar de Ceram como un mar.