María de Prusia (Königsberg, 23 de enero de 1579-Bayreuth, 11 de febrero de 1649) fue una princesa alemana.

Era la segunda hija del matrimonio entre el duque Alberto Federico de Prusia y la duquesa María Leonor de Cléveris.

Esta última era a su vez hija del duque Guillermo V el Rico de Jülich-Cléveris-Berg y de la archiduquesa austriaca María de Habsburgo-Jagellón.

Se casó en 1604 con el margrave Cristián de Brandeburgo-Bayreuth.

De esta unión nacieron: