Mapeo de asociación

Sin embargo, si estos estudios han sido clínicamente y/o terapéuticamente útiles, sigue siendo controvertido.

Sin embargo, la preocupación persistente con respecto a estos estudios es la adecuación de los casos y controles coincidentes.

En respuesta a esta preocupación, Falk y Rubenstein en 1987, sugirieron un método para evaluar el riesgo relativo que utiliza controles basados en la familia, obviando esta fuente de error potencial.

En el mundo real es muy difícil encontrar individuos independientes (no relacionados).

Todavía hay otra limitación en el mapeo QTL basado en la población; cuando la frecuencia del alelo favorable debe ser relativamente alta para ser detectada.

En el mapeo de asociación basado en la familia en lugar de múltiples individuos no relacionados, se utilizan múltiples familias o pedigríes no relacionadas.

[6]​[7]​ Un problema importante con los estudios de asociación es la tendencia a encontrar falsos positivos.

La estructura de la población conduce a asociaciones espurias entre los marcadores y el rasgo.

Pero en el mapeo de asociaciones, donde las relaciones entre poblaciones diversas no se entienden necesariamente bien, las asociaciones marcador-rasgo que surgen del parentesco y la historia evolutiva pueden confundirse fácilmente con las causales.